万北遗址位于沭阳县城北15公里，东距老沭河约2公里，现属淮阴市沭阳县万匹乡万北村。1987年春南京博物院和淮阴市博物馆在沭阳考古普查中发现。遗址范围高出四周地表约2米，总面积达10万平方米。
1987年至1988年南京博物院、淮阴市博物馆曾对该遗址进行过试掘和两期正式发掘，揭露面积500平方米。遗址文化堆积较厚，一般达3.5米左右，遗址包括有墓葬和灰坑。按时间阶段的变化，该遗址文化堆积自下而上为新石器早期文化遗存、青莲岗文化、大汶口文化和岳石文化遗存，还有商代晚期墓葬。
新石器时代早期文化遗存，放射性碳素断代并经校正的年代，为距今6540年左右。陶系以桔红色的泥质陶为主，夹砂陶次之，主要出土器物为泥质陶钵和夹砂陶罐，以釜、罐为主要炊器，以手制为主，生产工具中石器少见，而渔猎用的骨器特别丰富，并有较多的骨针。地层中含有大量的贝壳。
青莲岗文化遗存包括灰坑和幼儿墓葬，主要出土器物有鼎、壶、钵、罐等，器表盛行刻划线纹，并伴出较多的内彩陶片，彩饰以水波纹和网状丝纹为主。该期缺乏石制生产工具而出有大量的骨制生产工具，并含有大量兽骨，经鉴定有糜鹿、梅花鹿、猪、狗等，幼儿墓葬仰身直肢，陪葬内彩陶钵和小口双耳罐，陶钵覆盖头部。
大汶口文化遗存，包括有墓葬，出土陶器有鼎、豆、罐、盆、壶、盉、钵、鬶等，石器有斧、铲、锛。内部彩绘已不见，仅见外部绘彩陶器。时间上大体为大汶口文化中期花厅期相当。
岳石文化遗存，仅发现于遗址偏东的局部范围，陶器以夹砂红褐为主，灰陶次之，主要出土器物为尊、罐、杯、鬲、甗、蘑菇状钮盖等，器物大多轮制，器壁厚、突棱发达。
商代晚期墓葬。皆东西向的竖穴浅坑墓，葬式仰身直肢，头东向。发现具有腰坑的殉人墓，大多数为单人墓。随葬品多数墓有铜兵器、生产工具以及陶器。陶器种类有鬲、甗、罐、豆、簋、觚等，有的则具有较强烈的地方性特征，一般素面或饰三角形刻划图案。
万北遗址的发现和发掘为探讨淮河下游的新石器时代文化类型提供了重要资料，并对研究商文化和东夷文化的关系提供了重要线索。
2011年12月19日，江苏省人民政府将其公布为第七批省级文物保护单位。