客家族谱博物馆成立于2000年，馆藏的客家族谱达153个姓氏、2900多部、20000多册，并藏有19000多份客家契约以及百多幅祖图和神明崇拜图等宗族文献档案，经鉴定的馆藏文物20875（件/套），三级以上珍贵文物687（件/套），成为海内外规模最大、藏品最丰富的客家族谱收藏中心和研究交流基地。该馆充分利用馆藏血缘文化这一优势，为包括台湾同胞在内的数以万计的客家乡亲、专家学者提供寻根探源、族谱对接、科学研究等服务，以鲜明的特色、丰富的活动和卓有成效的工作成为上杭县乃至福建省独特响亮的客家文化名片，成为福建省首批对台交流基地。此外，还是台湾联合大学、华南理工大学、赣南师范学院、龙岩学院两岸四所高校“客家族谱研究教学实践基地”，是龙岩市爱国主义教育基地、龙岩市中小学生研学教育基地、县级青少年传承客家传统文化的教育基地。
2018年，客家族谱博物馆获评国家三级博物馆，标志海内外客家人格外关注的客家族谱博物馆正式列入国家馆行列。