同文书院位于江西九江。清同治六年(1867)美国传教士尔利陶理、吴恪矩等经清政府同意创建于城外土桥，命名为“埠阆小学”。后来随着学校规模的扩大，学校选择城内南门口甘棠湖畔为新校址，并取《中庸》“普天之下，车同轨，书同文”之意，定名为“同文书院”，为江西省第一所教会书校。教授内容除近代文化科学知识外，还注重宗教教育。1906年，校长库思飞在该地挖地基的时候，挖出三大坛唐开元古钱，他把这些古钱拿到美国换得巨款，加上美国教会本身筹集的一部分钱，建教学楼(今九江二中实验楼)，并更名为南伟烈大学，以纪念其父。1917年停办大学，集中精力专办九江南伟烈中学。1929年，“南伟烈中学”更名为九江同文中学。1951年6月11日，改名江西省立浔阳中学。1959-1962年，一度在此办九江大学。现为江西省级文物保护建筑，为九江二中(同文中学)所在地。
书院分设小学部、中学部、神学部、大学部等四组。学期小学3年，中学4年，神学2年，大学2年。建院初期书院有外国教师4名，中国教师8名，学生80余名。每位学生1年学费食费合计60元。书院经营除收取学生费用外，美以传道会每年补助一万二千元。
2013年5月，国务院（国发[2013]13号）公布九江同文书院为第七批全国重点文物保护单位。