佛坪国家级自然保护区位于陕西省佛坪县西北部，地处秦岭中段南坡，东径107。40'~107。55'、北纬33。33'~33。46'。周围与陕西省龙草坪林业局、陕西周至国家级自然保护区、陕西老县城自然保护区、陕西省太白林业局、陕西长青国家级自然保护区和佛坪县岳坝乡为邻，东、西、北三面均以山脊为界，南侧以山脊、河流或道路划分。东西纵深24.8公里，南北横延22.0公里，面积29240公顷。
佛坪自然保护区地处秦岭大熊猫分布的中心地带，种群密度居全国之冠，野外遇见率最高。现存大熊猫的几大隔离种群中，秦岭的大熊猫代表了原始的类型，在外貌形态上是最漂亮的一族，被认定为秦岭亚种。
佛坪自然保护区是秦岭大熊猫野外研究基地，保证了大熊猫自然状态下的家园和“竹林隐士”的野外生存能力。秦岭动物区系中的旗舰物种是大熊猫，而作为旗舰物种的保护效应，还保护了哺乳动物87种，鸟类340种。保护区由于地处动物地理上东洋界和古北界交汇地，栖息地优良，不但物种丰富，而且具有明显的过渡性。区内冬无严寒，夏无酷暑，温暖潮湿的气候，980—2904米高落差的海拔，造就了明显的植被垂直分带，有高等植物242科777属1769种，奇花异草，茫茫林海，构成了重峦叠嶂，景色秀丽，气象万千的旖旎风光。
复杂的地形地貌，多样化的气候环境东西走向的山脉在冰期对寒冷气流的阻隔以及南北动物区系的混杂交汇，孕育了秦岭地区极为丰富的生物多样性，秦岭因而成为全球物种的“天然基因库”，其中包括大熊猫、金丝猴、扭角羚、华南虎、朱鹮，独叶草、红豆杉、厚朴、珙桐等一大批珍稀濒危的动植物种类。