固始根亲博物馆以姓氏寻根为主题，是河南省唯一以姓氏寻根为主题的博物馆，毗邻县行政中心，占地4000平方米，总建筑面积1万平方米，为花园式四层建筑，造型独特，庄重典雅，“四门敞开式”设计，充分体现固始的开放包容、根连四海的人文精神。根亲博物馆于2006年5月奠基兴建，总投资近3000万元。2008年底建成并向社会免费开放，2010年完成对博物馆布展（二期）的充实提升。
根亲博物馆根据固始历史发展脉络，着重突出两大陈展内容：
一是以出土文物为主线。集中展示了从新石器时代到近代的各类精品文物300多件，凸显了具有鲜明的区域特色文化形态和厚重的人文历史；
二是以固始历史上四次向东南沿海移民为主线的根亲文化展览。以中原文化与闽南文化、客家文化一脉相承为主题，分固始士民徙闽条件、陈氏将军入闽、三王入闽、两宋士民入闽四部分。重点突出开漳圣王陈元光、闽王王审知两位领军人物的生平事迹、开疆拓闽的丰功伟绩和泽被后世的深远影响。
根亲博物馆布展设计紧扣根亲主题，展览以两棵枝繁叶茂的根亲树为起点，象征着海峡两岸根脉相连，同祖同源。使用寓意“燕归来”的“玄鸟”作为固始根亲文化的标志，并将具有文化传承标志性意义的徽派建筑与客家土楼作为展览的主轴，贯穿始终，体现中原文化与闽南文化、客家文化的交流融合。通过集中展示文物发现、发掘过程，文物的历史背景，固始四次南迁移民历史，固始与闽台渊源关系，涉台历史名人及南迁先民开疆拓闽历史功绩，姓氏源流、谱牒和书画作品，民间交流互动等信息，综合运用实物模型、场景再现、三维动画、多媒体、图表数字、文字说明等表现手法，翔实诠释了豫闽台两岸三地一脉相承的历史渊源和根亲文化的独特魅力。
根亲博物馆作为爱国主义教育的重要阵地，在弘扬根亲文化、提升全民素养、丰富群众精神生活等方面发挥着重要的作用。根亲博物馆，坚持以面向社会、服务社会、弘扬文化为宗旨，不断优化服务功能，创新服务方式，改善服务设施，配套开设了“文化馆、图书馆”，形成了以博物馆为支撑，“三馆”齐备的综合服务功能，成为群众文化娱乐、陶冶情操的精神家园。通过与全县各中、小学校及社会群团组织建立合作机制和会员协议，常年到博物馆参观、寻根、阅览、活动的中小学生、社会群众和台侨胞及其眷属人流如织，络绎不绝。开馆至今，先后接待--、张怀西、陈云林、汪毅夫、梁国扬、卢展工、郭庚茂等领导及各界来访宾客、海内外各姓氏宗亲、县内民众等累计几十余万人次，其中接待台湾各界人士近4000人次。
作为传承文化遗产的殿堂，根亲博物馆已成为固始城市的靓丽名片，更成为对外根亲联谊的纽带和文化交流的平台。
2012年，根亲博物馆被中台办、国台办授予“海峡两岸交流基地”。